kusanagiでLets encrypt を自動更新設定してるんだけども、うまくいかないケースの対処法

https化は時代の趨勢だとわかっているけれども、対応するのに困ってる人は多いと思います。
conohaでkusanagiを使うとめっちゃ簡単にhttpsに対応できて便利なんです。
でも、今回は、自動更新がうまくいかず、chromeに怪しいサイト認定されてしまったのでその原因究明をしてみましたとさ。